一、关于的合法性问题根据第51条、第141条、第162条的规定，取保候审的条件与起诉、作出有罪判决的条件不同，对事实和证据的要求也存在较大差异，不能简单地根据人民不起诉、人民终止审理或者作出无罪判决认定机关采取的取保候审违法。取保候审是否合法应当依据刑事诉讼法的规定来确认。二、关于是否退还保证金问题对于人民不起诉、人民终止审理或者判决无罪的案件，机关应否退还已经没收的取保候审保证金问题，应当分析具体情况，分别处理：(一)被取保候审人在取保候审期间未违反刑事诉讼法第56条规定，也未故意重新犯罪，而被没收保证金的，没收的保证金应当退还。(二)被取保候审人在取保候审期间违反刑事诉讼法第56条的规定，被依法没收保证金的，原则上不退还；如果被取保候审人确实无罪，且违反规定行为的情节较为轻微，其被没收的保证金可以退还。
