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一种高通量测序的RNA数据处理方法

来源:刀刀网
(19)中华人民共和国国家知识产权局

(12)发明专利申请

(21)申请号 CN201811130687.5 (22)申请日 2018.09.27

(71)申请人 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学

地址 436000 湖北省鄂州市梧桐湖区凤凰大道特一号

(10)申请公布号 CN109559780A

(43)申请公布日 2019.04.02

(72)发明人 宁康;钱晓波;陈超云;杨朋硕

(74)专利代理机构 上海精晟知识产权代理有限公司

代理人 熊娴

(51)Int.CI

权利要求说明书 说明书 幅图

(54)发明名称

一种高通量测序的RNA数据处理方法

(57)摘要

本发明公开了一种高通量测序的RNA数据

处理方法,所述数据处理方法以高通量测序的RNA读段建立数据库,去除读段中的接头引物和低质量碱基,多重序列对比识别内源污染序列和外源污染序列并清除,获得处理后的RNA数据。本发明不仅达到数据高质量化的目标,同时将更多的重点放在污染识别和去除的方法上,比较有针对性地且使用DNA条形码的方式来识别污染,而且在处理后能够保留大部分数据信息,缩小与

真实情况的差距,经过组装并利用生物DNA条形码(barcode gene)建立隐马尔科夫模型(HMM)的方法,搜索识别污染来源,比对去除污染序列,使得处理过后的高质量数据达到研究所需的要求。

法律状态

法律状态公告日

2019-04-02 2019-04-02 2019-08-20

法律状态信息

公开 公开

实质审查的生效

法律状态

公开 公开

实质审查的生效

权利要求说明书

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说明书

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