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解决方案1:
多肽问题汇总解答
专肽生物如何对合成的多肽进行质检?
答案:专肽生物对所有合成肽均进行HPLC(高效液相色谱)和MS(质谱)分析,并提供相应的检测报告。采用反相色谱法纯化多肽,通过质谱法测定肽的分子量以确认产品正确性,MS检测结果还能显示大部分主要杂质。所有交付的肽均达到客户要求的纯度,未达到纯度要求的多肽会被丢弃,但如有需要,也可提供给客户。
如何解释MALDI(MS)中的P+Na和P+K峰?
答案:MALDI质谱中经常出现的Na峰和K峰来源于溶剂水中的痕量钠离子和钾离子,这些离子无法完全去除,会在质谱分析时离子化并与肽的自由羧基结合。因此,MALDI MS图谱中出现钠峰和钾峰是不可避免的。
为什么要进行N端乙酰化,C端酰胺化修饰?
答案:这些修饰可以保护肽不被降解,同时模拟肽在母本蛋白中α氨基和羧基的原始状态,避免引入多余电荷,防止外切酶作用,使肽更加稳定。
如何将多肽溶解在DMSO中?
答案:疏水性多肽可以较容易地溶解在DMSO(二甲基亚砜)中。但需注意DMSO对细胞的毒性作用,高浓度DMSO不可应用于细胞培养中。对于疏水性非常高的多肽,可先尝试将其溶解在少量DMSO中,然后慢慢添加到不断搅拌的水溶液(如PBS)中,直至理想浓度。超声波有助于多肽溶解。细胞培养中DMSO的终浓度一般推荐为0.5%,部分细胞可容忍1%而不表现出严重毒性,但原代细胞更敏感,浓度应低于0.1%。
磷酸化修饰多肽的设计有什么建议?
答案:建议磷酸化的氨基酸以后的残基不要超过10个,即从N端往C端数,磷酸化氨基酸之前的氨基酸残基最好不要超过10个,以提高偶联效率。
如何选择多肽N端修饰和C端修饰?
答案:肽的末端默认为N端游离的氨基,C端游离的羧基。为了与母本蛋白更为接近,通常选择N端乙酰化,C端酰胺化修饰,以避免引入多余电荷,防止外切酶作用,使肽更加稳定。
我需要合一条环肽,其中含有一个色氨酸,它会被氧化吗?
答案:色氨酸的氧化是肽氧化中的常见现象。环肽一般是先环化再纯化,如果色氨酸发生氧化,肽在HPLC柱上的滞留时间会发生变化,因此被氧化的肽可以通过纯化去除。另外,氧化的肽也可以通过MS检测到。
如何确定肽已成环?
答案:一般采用Ellman反应来检测成环反应是否完全。如果检测结果为阳性(黄色),说明成环反应不完全;如果检测结果为阴性(不是黄色),说明成环反应已进行完全。
含有Cys的多肽在出货前经过还原了吗?
答案:如果没有发现肽已经被氧化,一般不对Cys进行还原。多肽在pH 2条件下纯化、冻干,这样的条件至少在一定程度上防止了Cys的氧化。含Cys的肽在pH 2条件下纯化,除非有特殊原因需要在pH 6.件下纯化。如果纯化在pH 6.8进行,纯化产物必须马上用酸处理以防氧化。在最后的质量控制环节,如果MS图谱上发现有分子量为(2P+H)的物质存在,说明Cys已经氧化形成二聚体。
荧光标记时,肽和修饰标记的染料之间需要加一个间隔吗?
答案:为了避免多肽与荧光标签之间发生相互作用,维持蛋白的构象及其生物学活性,推荐引入一个可弯曲的间隔区,如Ahx(含有6碳分子的环状结构)。荧光染料既可以标记在蛋白的氨基端也可以标记在蛋白的羧基端,但为了便捷高效地合成多肽,推荐选择标记在氨基端。
多肽一般有哪几种盐的形式?通过什么方式转盐或脱盐?
答案:多肽以TFA盐的形式最多,其次有醋酸盐及盐酸盐等形式。转盐方式多为离子交换法和HPLC法,脱盐可用G25柱。醋酸盐及盐酸盐的价格比TFA的价格高出20%-30%。
在多肽检测过程中经常出现基线漂移的原因是什么?怎么解决?
答案:固定三氟乙酸(TFA)浓度的梯度洗脱有时会在210-220nm检测处造成吸收基线的漂移。降低或消除基线漂移需要尽量使检测波长靠近215nm,并在溶剂B中比在溶剂A中少加15%的三氟乙酸进行补偿。
影响多肽纯度检测结果的因素有哪些?
答案:影响多肽纯度检测结果的因素主要包括流动相体系、色谱柱型号、柱温、波长及色谱仪的性能指标。每一项不同都可能造成结果产生误差。
有哪些流动相体系或离子对试剂可用于多肽的分离纯化?
答案:最常用的离子对试剂是三氟乙酸(TFA),能调节洗脱液的PH,同时作为离子对试剂与多肽相互作用,增强分离效果。其它可用于多肽分离纯化的流动相体系或离子对试剂包括醋酸体系、磷酸体系、盐酸体系、七氟丁酸等,通过适当调节PH都能取得很好的分离效果。
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